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一文学会单细胞转录组的CellRanger（二）前面说了cellranger安装和一些简单的使用，我们继续看一下cellranger的结果。一文学会单细胞转录组的CellRanger（一） -...
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STOmics-seq：Stereopy教程（二）本期内容展示Stereopy的Cell Bin的处理，即bin1的时候的教程 一、代码教程 1、读取数据生成 StereoExpData 对象 ...
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STOmics-seq：Stereopy教程（一）一、背景介绍 大家其实对华大测序的原理什么的都知道，但是以下概念是比较重要的，什么是DNB，bin，我们怎么选择binsize的大小等问题就至关...
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R包安装时报错 package xxx is not available (for R versionXXX)
Warning in install.packages :package ‘STRINGdb’ is not available (for R ...
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单细胞量化代谢活性-scMetabolism一、scMetabolism的安装 scMetabolism是一个R包，用于在单细胞分辨率下量化代谢活性，目前只适用于物种是人的单细胞数据。作者...
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一文学会单细胞转录组的CellRanger（一）一、什么是Cell Ranger？ Cell Ranger 是一组分析管道，用于处理 Chromium 单细胞数据，将fastq原始数据经过比对...
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ChIP-Seq——MAnorm差异分析
一、 MANorm介绍 MAnorm是一个稳健的模型，用于定量比较 TF（转录因子）或表观遗传修饰的 ChIP-Seq 数据集。MAnorm 使...
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单细胞免疫组库VDJ——scRepertoire （四）一、介绍 scRepertoire 旨在从 10x Genomics Cell Ranger 管道中获取过滤器 contig 输出，处理该数据以...
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非模式物种KEGG富集数据库准备（二）一、KEGG数据下载 1、先进入官网：https://www.kegg.jp/[https://www.kegg.jp/] 2、进入KO (KE...