贵树和明里都因为家里工作原因经常转学，两个人因为转学而相遇，同样有一天因为转学而分离，又因为转学而渐行渐远。然后终于，两人强烈而真挚的感情渐渐消散不见，只在彼此心里留下1995年初二时雪夜里最后相见的回忆。
整部影片都充斥着哀伤的氛围，即使看完之后这种氛围仍然缠绕在心里久久消散不去。这种悲伤源自于哪里？是两个人的分离，是美好感情的逝去，还是面对现实的无力？但是更让人忧伤的或许是一种茫然以及在茫然中的挣扎。
或许是从雪夜里樱花树下的那个吻开始，两个人就开始茫然了，茫然这段感情到底最终会如何，自己又该如何面对这段感情，所以贵树没有告诉明里花了两个星期写给她的信掉了，而明里也没有把写好的信交给贵树。小学时坚信两个人会去同一所中学，会永远一直走下去，但如今两个人在不同的城市上学，连见一次面都那么困难，8个小时的新干线才终于让两个人在暴风雪的午夜见上一面。而之后贵树还要搬去鹿儿岛，两个人相距更远，如果选择守着这份爱情，连见面都难以做到的彼此该如何给彼此的心灵安慰和温暖，是否只会给两颗彼此牵挂的心徒添伤害，如果选择放开这份感情，这叫人如何去割舍。
在这样的茫然中，两个人互相通着信件，每天检查信箱里是否有来自对方的信件，期待着来自对方的一点信息。收到信件的喜悦掩盖着内心的茫然，相信着彼此依旧能够走下去，但这种茫然终于越来越强烈，然后通信也在高中时终于断了，留下彼此看着空荡荡的信箱时的失落。为何深爱的两个人选择断了联系？或许不是选择断了联系，只是没有勇气继续联系，所以之后各自有了手机，不需要一个月一封信的去交流，也仍然没办法将心里的话发送哪怕一个字给对方。只能靠信件交流的两个人，不能分享彼此的喜悦，不能分担彼此的悲伤，不知道陪在对方身边的那个陌生人又是谁。然后终于发现，原来这段感情再也没办法走下去，再也没办法回到最初的状态，再也不是对方身边的那个TA。
明明已经知道再也回不到从前，仍然放不下从前，拒绝身边的幸福，拼命追寻远方的彼此。花苗从贵树转学过来那天起就喜欢上了贵树，喜欢了4年，但是贵树从来没有回应过这份感情，仿佛全然不知，抗拒着身边的幸福，只是望着远方，编辑着根本不会发送出去的思念。不知道为何，贵树坚定地要考东京的大学，或许是那段书信来往的日子彼此约定好，或许是觉得明里可能也会来东京读书，又或者，只是怀念着小学时两人在东京的那段短暂而甜蜜的日子。而明里经历着什么，无从得知。
转眼间大学毕业，工作也已经四年了，贵树依然困在逝去的感情中，2007年底，交往了三年的女朋友提出了分手，几个月后在短信里写道：“我到现在还是喜欢你，但我认为即使互通了一千条短信，我们的心也只能拉近一厘米而已。”而就在贵树和女朋友分手的时候，明里刚刚和男朋友订婚。2008年初，贵树拖着日益失去弹性疲惫不堪的心辞职了。
樱花盛开的季节，分别13年的贵树和明里终于在铁道口插肩而过，彼此回眸的瞬间，却被疾驰而过的电车挡住了视线。当电车通过时，明里已然不在，不知道明里是在什么时候放下的，而贵树在此时也终于放下，两个人终于从13年前走出了13年前那个夜晚，开始走向新的黎明。
新海诚的动画到此就结束了，而漫画的结尾花苗来到东京找到了贵树。分别8年，花苗一定也在迷惑中挣扎，而如今，她也用不同的方式走出了茫然，勇敢的来追逐自己的爱情。
